我國是世界上水產養殖規模大的國家，但由于傳統養殖方式存在的規范化程度低、養殖模式簡單、水資源浪費大、污染嚴重等問題，導致產能嚴重滯后。近年，由中國水產研究院聯合相關科研和推廣部門，對工廠化循環水養殖系統開展了全面研究。我國的南方地區海岸線長，網箱和土塘養殖發達，但存在各種魚、蝦苗種供應不足和孵化育苗存活率低、臺風等自然災害較多、工業污染水源等問題。

目前我國平均每立方米的產量為7.4 公斤（淡水為8.2公斤、海水為6.4公斤），全國范圍循環水養殖發展力不足的特征仍較明顯。目前工廠化養殖的方式大體上分為流水養殖、半封閉循環水養殖和全封閉循環水養殖等三種形式。受水處理成本的壓力，仍主要以流水養殖、半封閉循環水養殖為主，真正意義上的全工廠化循環水養殖工廠比例極少。我國工廠化循環水養殖發展中存在的問題，主要還是受限于經濟實力、產品市場、養殖品種、養殖規模、經濟效益比等因素，主觀上還受限于養殖者對養殖技術的掌握和對先進技術的利用。

在藻類生長所需的大量元素中，磷、氮通常是水體浮游植物增長的限制性因子，總氮大于1.2毫克/升、總磷大于0.11毫克/升時水體開始富營養化，在淡水中當總磷小于0.1毫克/升時藻類生長發展為磷限制。而過高的磷輸入如總磷為1.65毫克/升，并不能促進藻類生長。要培養出養殖所需要的有益藻、抑制藍藻、裸藻等有害藻，我們需要重點關注一些化學指標，總堿度、硬度、鹽度、氮、磷、碳以及微量元素鈣、鐵、錳、鋅等有可能成為限制性因子的指標。池塘中的有機質含量可通過檢測水中有機耗氧量得知，水中有機質含量高，氮磷的含量也會高，在降氨氮同時可以降低水體有機質含量。