工廠化循環水從水處理的側重點不同分為機械模式和生化模式，主要區別就是看能耗大小，本文所講的是生化模式。這個模式能否成功，與虹吸能否順利運行有直接關系，虹吸設備需要時常維護否則會莫名其妙的失效。有人說：我都準備投入了30萬，你告我天天還得維護，這是搞毛線啊？虹吸失敗的話，整個系統視養殖密度在兩天到四天以內崩潰----魚蝦死光光。工廠化循環水系統的重點是凈水系統，占比50%；生物習性占30%；其他的溶氧恒溫等條件的占比20%。

循環水養殖系統作為一種新型養殖模式，通過一系列水處理單元將養殖池中產生的殘餌糞便、氨氮（TAN）、亞硝(xiao)酸鹽氮（NO2–N）等有害污染物加以去除,凈化養殖水體環境為目的，利用物理過濾、生物過濾、去除CO2、消毒、增氧、調溫等處理將凈化后的水體重新輸入養殖池的過程。其不僅可以解決水資源利用率低的問題，還可以為養殖生物提供穩定可靠、舒適優質的生活環境，為高密度養殖提供了有利條件。

目前我國平均每立方米的產量為7.4 公斤（淡水為8.2公斤、海水為6.4公斤），全國范圍循環水養殖發展力不足的特征仍較明顯。目前工廠化養殖的方式大體上分為流水養殖、半封閉循環水養殖和全封閉循環水養殖等三種形式。受水處理成本的壓力，仍主要以流水養殖、半封閉循環水養殖為主，真正意義上的全工廠化循環水養殖工廠比例極少。我國工廠化循環水養殖發展中存在的問題，主要還是受限于經濟實力、產品市場、養殖品種、養殖規模、經濟效益比等因素，主觀上還受限于養殖者對養殖技術的掌握和對先進技術的利用。