養殖過程中產生的殘餌、糞便，有部分無法通過換水排出而吸附在池壁池底。洗池對于排出養殖池底的污物有一定效果。無死角的養殖池形狀結合向中央傾斜的池底和中央排污方式，可以有效的排出池底污物。當同一個養魚池中魚的大小、強弱不一時，會嚴重影響魚的生長速度，因而，養殖過程中必須按時進行大小分選。魚的大小分選不僅可以防止互殘（半滑舌鰨的互殘的情況很少發生），而且便于進行管理，尤其是幼魚，幼魚生長比較快，分選和不分選，幼魚的生長、死亡率和餌料的利用率相差很大。但要盡可能減少分養次數，過多次數的分養會使魚體受傷，增加魚的應激反應。

生化過濾依靠的是硝化細菌，硝化細菌的數量直接影響凈水效能。硝化細菌的數量和濾材的表面積有關：表面積越大就能附著越多的硝化細菌。有資料顯示，火山石的比表面積是300平方米/立方，K1是500平方米/立方。還有一種micro k1的東西，國內電商平臺上面沒有見過，比表面積是950平方米/立方。常見的過濾還有沼澤過濾，這個屬于是被動過濾，濾材上的硝化細菌因為得不到足夠的氧氣，硝化反應比較慢，大多數商超暫養用的就是這種過濾，優點是建造完成后基本無需維護。

未來社會工業化的發展趨勢以及世界先進養殖模式的發展水平預示，工廠化循環水養殖系統將是未來水產養殖的重要模式。因此，工廠化循環水養殖是我國水產養殖的重要發展方向。國際上沒有工廠化養殖這一提法，與工廠化循環水養殖系統相對應的是循環水養殖系統（RAS），其主要特征是水體循環利用，日均水利用率在95%以上，如低于此指標，即為流水養殖。工廠化循環水養殖與傳統養殖方式相比，具有節水、節地、高密度集約化和排放可控的特點，符合可持續發展要求，是未來水產養殖方式轉變的必然趨勢。