工廠化循環水養殖的實質是養殖生產的工業化，生產過程可控，可以跨季節養殖，產品像工業品一樣可以有計劃地均衡上市。其特點：一是用水量少，可利用較低質水源，對水資源要求較低；二是占地少，對土地資源的要求低；三是養殖密度高，單位耗水產量大；四是易于控制生長環境，魚類(以及其他養殖種類)生長速度快，生長周期短；五是飼料利用率高；六是水循環使用，利用系數高；七是排放的廢水廢物少，能集中處理，對環境無壓力或很小；八是不受外界氣候的影響，可實現常年生產。

工廠化循環水養殖系統的典型工藝和裝備是以物理過濾結合生物過濾為主體，對養殖水體進行深度凈化，并集成了水質自動監控系統，實時監測并調控養殖水體質量并可追溯。該系統具有工藝技術完善、水處理效果好、水質狀況穩定、生產操作舒適、設備維護簡便、運行成本低、系統投資省等優點。這是一套簡潔有效的工藝技術路線：魚池出水自流進入微濾機池，去除殘餌和魚糞等顆粒直徑大于60微米的固體懸浮物質，經水泵提升進入生物濾器，一方面截流微小的顆粒懸浮物，另一方面對水體中的氨氮進行降解，凈化后的水自流回魚池。

結合工廠化循環水養殖系統的特點，研究開發出節能環保，占地面積少，土地使用效率高，能有效隔離病害和控制病源的侵入，降低魚苗的攜菌和發病率的封閉式工廠化養殖循環水處理系統：在臺風自然災害較多的南方，工廠化循環水養殖可有效抵御自然災害對水產養殖業毀滅性的打擊。在循環水養殖系統中，重要的就是水質的凈化處理，這關乎到水產養殖的成敗。目前，傳統的循環水養殖系統由于大量電力化設備的使用，能耗特別高，加之部分設備耐腐蝕性差，成為現在做循環水養殖頭疼的事情。