在分解細菌的作用下，再進一步轉化成了氨。被魚類吃掉的一部分經過魚類的消化，也轉變成氨。殊途同歸的氨在分子態時是一種劇毒物質。在硝化細菌的作用下，它會被轉化成亞鹽。亞鹽是一種不太穩定的物質。在高氧化還原電位的情況下，會被氧化成亞鹽。此時如果有反硝化細菌，鹽就會被轉化成N2從水中溢出。這樣，水體中的氮元素就完成了一個完整的轉化分離過程。 在實踐中，生物過濾的細菌需要適宜的條件才能起到相應的作用。如水體的溫度、PH、溶氧量、合適的碳氧化、殺菌劑等。因此，不僅要求其他系統設備與生物過濾器配套，更對操作者有一定的技術要求。

工廠化循環水養殖的實質是養殖生產的工業化，生產過程可控，可以跨季節養殖，產品像工業品一樣可以有計劃地均衡上市。其特點：一是用水量少，可利用較低質水源，對水資源要求較低；二是占地少，對土地資源的要求低；三是養殖密度高，單位耗水產量大；四是易于控制生長環境，魚類(以及其他養殖種類)生長速度快，生長周期短；五是飼料利用率高；六是水循環使用，利用系數高；七是排放的廢水廢物少，能集中處理，對環境無壓力或很小；八是不受外界氣候的影響，可實現常年生產。

工廠化循環水養殖處理系統是我司自主研究開發的一種新型水處理工藝養殖系統，系統主要由養殖池、循環水養殖處理系統、增氧系統、補水系統等部份組成。其功能是：養殖池培育養殖品種、養成、暫養或苗種標粗：首先養殖池的水進入ZH-PM滾筒微濾系統對殘餌、糞便、大顆粒懸浮物進行分離預處理再由循環水泵抽需要處理的水進入ZH-NPS蛋白質分離器利用氣浮方式去除養殖水中懸浮物及水溶性膠狀體、纖維素、蛋白質、殘餌、糞便等有機物：同時加入臭氧，利用臭氧的強氧化性，氧化破壞和分解細胞內酶而迅速使各種病源菌致死，同時達到除色、去除異味、改善水質。